FFPE サンプル由来の RNA 品質の評価

FFPE RNA サンプルの品質を迅速に判定 | Agilent 2100 バイオアナライザシステム - DV200 の測定

FFPEサンプル由来の RNA品質を迅速に評価

2100 バイオアナライザシステムまたは 4200 TapeStation システムでは、サンプルの DV₂₀₀ 値 (200 nt 以上のRNA断片の比率) を迅速に計算できます。アジレントの SureSelect XT RNA Direct をはじめとする多くの RNA 発現プロトコルで、この値に基づいた FFPE サンプル処理のガイダンスが得られます。

詳細情報

詳細については、資料 (テクニカルノート) をご覧ください。

ご利用の手順

Agilent 2100
バイオアナライザシステム

DV₂₀₀ アッセイは、Agilent 2100 Expert ソフトウェア B.02.08 以上でご利用いただけます。

Agilent 2100 Expert ソフトウェアの最新バージョンをダウンロードしてください。
アッセイ (.xsy) ファイル: DV200 RNA Nano と DV200 RNA Pico をダウンロードしてください。
DV200 RNA Nano.xsy または DV200 RNA Pico.sxy ファイルを Agilent 2100 Expert ソフトウェアの RNA アッセイフォルダに保存:
c:\Program Files (x86)\ Agilent\2100bioanalyzer\ 2100expert\assays\RNA

DV₂₀₀ の計算を既存のデータファイルに適用するには、次の手順を行ってください。

Agilent 2100 Expert ソフトウェアでデータファイルを開きます。
Assay Propertiesタブに移動します。
Import Setpointsをクリックして、適切な .xsy ファイル (DV200 RNA Nano または DV200 RNA Pico。開いているデータファイルによって変わります) を選択します。

アッセイパラメータがデータファイルに適用されます。詳細については、資料 (テクニカルノート) をご覧ください。

2100 バイオアナライザ- RNA ソリューション

Agilent 4200
TapeStation システム

DV₂₀₀ アッセイは、TapeStation Analysis Software A02.02 以上でご利用いただけます。

TapeStation ソフトウェアパッケージの最新バージョンをダウンロードしてください。

TapeStation Analysis Software でデータファイルを開きます。
上部の Regions をクリックします。
個々のサンプルまたはアクティブファイルの Region Analysis を適用するか、すべてのファイルのデフォルトとして設定します。

DV₂₀₀ 領域を定義すると、各サンプルの Reagion Table の % of Totalに値が表示されます。

詳細については、資料 (テクニカルノート) をご覧ください。

RNA 分析 - RNA / High Sensitivity RNA

本資料掲載の製品は全て研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。