染色体異常を検出/Cytogenetics マイクロアレイ

アジレントの次世代の FISH プローブ
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近年マイクロアレイ技術は、何らかの染色体異常が疑われるにも関わらず、通常の G-band では染色体に異常が検出されない
先天性疾患の原因特定などにおいて有用であることが多く報告されています ^{1), 2)} 。

　　　1) Miller, DT., et al., Am J Hum Genet. (2010) 86(5):749-64.
　　　2) The Year in Human and Medical Genetics 2009: Ann. N.Y. Acad. Sci. (2009)1151: 157–166

• 　アジレント CGH マイクロアレイ　関連論文リスト
  その他、Agilent CGH 関連論文につきましては弊社までお問い合わせください。

アジレント マイクロアレイには、染色体領域に生じる微細な構造異常 （重複、欠失） や LOH、片親性ダイソミーを高精度・高解像度に検出するソリューションがあります。（CGH 原理）

• 染色体全体のコピー数変化（重複・欠失）検出
• コピー数変化と片親性ダイソミー・LOHの検出
• 先天性疾患関連領域にフォーカスした構造異常検出
• フォーカスする領域や解像度を自由に設定して検出

CGH マイクロアレイ
テロメア・サブテロメア領域、RefSeq遺伝子領域、癌関連遺伝子を含むゲノム全体をカバー。
遺伝子領域における構造異常をより高解像度に検出

■ SurePrint G3 Human CGH 　　マイクロアレイ 1x1M
染色体全体に生じる約 10-20kb< の重複・欠失を明確に検出※ 　疾患関連遺伝子などにおける微細な構造異常の検出に。 　※染色体位置上のプローブ間距離：2.1kb （median値、overall ）、 　　　1.8 kb （median値、Refseq genes 領域）
■ SurePrint G3 Human CGH 　　マイクロアレイ 4x180K
１枚のスライドガラスにマイクロアレイが ４つ搭載されており、 　実験の効率化と １アレイあたりのランニングコストの削減を 　実現します。 　染色体全体に生じる約50-100kb< の重複・欠失を明確に検出※※ 　　※※染色体位置上のプローブ間距離：13kb （median値、overall ）、 　　　　　11kb （median値、Refseq genes 領域）

その他、解像度や １スライドあたりのマイクロアレイの数により、豊富な種類があります。

• アジレントCGHマイクロアレイ　ラインナップ詳細

CGH + SNP マイクロアレイ
CGH プローブと SNP 領域プローブを両方搭載。染色体全体のゲノムコピー数変化と UPD （片親性ダイソミー）、LOH （loss of heterozygosity） の両方を検出。

■ SurePrint G3 CGH+SNP 　　マイクロアレイ 2x400K
CGH プローブ数 ： 約300,000 　SNP プローブ ： 約65,000 SNP領域
■ SurePrint G3 CGH+SNP 　　マイクロアレイ 4x180K
CGHプローブ数 ： 約120,000 　　Probe spacing　 　　　ISCA マイクロアレイ標的領域 　　　　：5kb （maximum） 　　　　　（at least 10-20 probes/region） 　　　Overall 　　　　：25kb （median） 　　SNPプローブ ： 約60,000 SNP領域

■ 　SurePrint G3 Cancer CGH+SNP マイクロアレイ 4x180K

　the Cancer Cytogenomics Microarray Consortium (CCMC) デザインのマイクロアレイ

　癌関連 CGH プローブ数： ～20,000
　　Probe spacing
　　　: 1 probe/0.5–1 Kb
　　　　(min. 1 probe/exon, max. 200 probes/gene)
　　　　15 Kb fl anking regions of each gene

　ゲノムワイドCGHプローブ： ～100,000
　SNPプローブ： ～60,000

　500以上の癌関連遺伝子のエクソン・flanking region に加え、新規同定された約130 の癌関連・サブテロメア領域
　にもプローブを配置

製品詳細

• 　CGH+SNP マイクロアレイリーフレット （PDF）
• 　Cancer CGH+SNP マイクロアレイリーフレット （PDF）
• 関連資料1
• 関連資料2
• 実験プロトコル

注意 ： CGH+SNP マイクロアレイ解析に必要なソフトウェア、ライセンス、推奨 reference など詳細は下記をご覧ください。
　　　・　各種マイクロアレイ詳細・実験に必要なもの・解析原理・CGH+SNPマイクロアレイデータ解析ソフトウェア特徴
　　　　　（アジレントCGH+SNPマイクロアレイ実験の前にお読みください）
　　　・　各種ソフトウェアインストールガイドおよび操作説明書
　　　※　ユーザ名、パスワードにつきましては　email_japan@agilent.com (電話 0120-477-111) （平日　9:00-18:00） まで
　　　　　　お問い合わせください。

"Agilent SurePrint G3 Microarrays for the Detection of Single Exon Deletions, Uniparental Disomy, and Consanguinity" James R. Lupski, M.D., Ph.D.（Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine）

ISCA （International Standards for Cytogenomic Arrays） マイクロアレイ
The International Standard For Cytogenomic Arrays Consortium (ISCA) （診断用マイクロアレイの標準化やDatabase構築を目指した国際コンソーシアム）によりデザインされたカスタムアレイ。テロメア、セントロメア、微細欠失/重複領域、既知ハプロ不全関連遺伝子、X連鎖性精神発達遅滞など約500のターゲット領域をより高解像度に検出。（フォーマット：4x180K、2x105K、8x60K、4x44K）
受注製造マイクロアレイとしてご購入いただけます。

・　ISCAマイクロアレイ（CGH、CGH+SNP） リーフレット （PDF）

ISCA論文
　　　・Miller, DT., et al., Am J Hum Genet. (2010) 86(5):749-64.
　　　・Baldwin, EL., et al., Genet Med. (2008) 10(6):415-29.