SureSelect XT HS2 ターゲットエンリッチメントシステムを用いた効率的なロングリードシーケンス解析

Pub.No. 5994-7365JAJP

SureSelect XT HS2 ターゲットエンリッチメントシステムを用いた効率的なロングリードシーケンス解析

ロングリードシーケンシングは近年精度やスループットが向上し、Telomere-to-Telomere(T2T)コンソーシアムによる完全ヒトゲノムの解読にも貢献し、Method of the year 2022 に選ばれるなど注目を集めています。この技術においても、解析を行いたい領域のみをシーケンシング前に濃縮するターゲットエンリッチメントの手法は、コストパフォーマンスを改善し、スループットを大幅に向上できるものと考えられます。本アプリケーションノートでは、アジレント・テクノロジー社のSureSelect XT HS2 target enrichment system のプロトコルを一部改変することで、ロングリードシーケンシング向けのターゲットエンリッチメントが可能なことをお示しします。この改変されたメソッドにより、ターゲットエンリッ チメントを行った5 kb 程度のインサート長のライブラリを得ることが可能で、ナノポアシーケンシングの結果、良好なオンターゲット率、ターゲットカバレッジが得られました。

分野 ゲノミクス
キーワード SureSelect XT HS2、 target enrichment、 long read sequence、 ロングリードシーケンス、 ターゲットエンリッチメント、 DNA断片化、 プレキャプチャー、 ハイブリダイゼーション、 Pre-Capture、 Hybridization 
掲載年月 2024/05
ページ数 10ページ (PDFファイルサイズ 666kB)

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(PDF 667KB)